ЦАГИ проводит гибкую политику в области охраны создаваемых программных средств.
В зависимости от типа программного средства, его научной, технической и коммерческой значимости используются такие способы охраны, как регистрация в уполномоченном органе Российской Федерации по интеллектуальной собственности, сохранение в режиме коммерческой тайны, засекречивание.
В 2009 г. ЦАГИ получил 15 свидетельств об официальной регистрации программ, а всего на начало 2010 года институтом получено 77 свидетельств РФ об официальной регистрации служебных программ для ЭВМ и баз данных.
Зарегистрированные cвидетельства на ПО, по годам:
XXIII Научно-техническая конференция по аэродинамике, 1-2 марта 2012 г.
ЦАГИ – ONERA: 10-й научный семинар, 20 февраля 2012 г.
ЦАГИ вновь стал членом STAI, 18-20 сентября 2011 г.